PESS sequences (1019 8-mers) Reference cited should be: Zhang and Chasin, Genes and Development, 18: 1241-1250, 2004, Computational Definition of Sequence Motifs Governing Constitutive Exon Splicing The z-score cutoff we use to define a PESS is <=-2.62 This list differs slightly from the one originally posted. 10% redundancy has been removed from the noncode.txt file and the Z-scores have been updated accordingly. To keep the same false discovery rate, Z-score cutoffs have been adjusted to 2.62 (rather than the original 2.88) in defining PESS or PESEs. 90% of the original PESSs are still in the list after the update. We thank Will Fairbrother for pointing out the redundancy problem. aaaaaaaa aaaaaaat aaaaaaca aaaaaata aaaaaatg aaaaaggt aaaaagtt aaaaataa aaaaatag aaaaatat aaaaatgc aaaaatgt aaaataaa aaaatatc aaaatgat aaaatgca aaaatgct aaaatggt aaaatgta aaaatgtc aaaatgtt aaacaaaa aaacatgt aaacctta aaaccttt aaactgtt aaagcttt aaagtata aaataaaa aaataaca aaatagct aaataggt aaatatat aaatcgtt aaatgaca aaatgata aaatgatg aaatgcag aaatgctt aaatggct aaatgggg aaatgggt aaatggta aaatggtc aaatggtt aaatgtaa aaatgtag aaatgtca aaatgtct aaatgtta aaatgttt aacacaca aacagggt aacagttt aacatata aaccgttt aacctttt aacgcttt aactgtta aaggtata aaggtatg aagtaatg aagtatag aataatgt aatagggt aataggtg aatagtat aatatata aatatggt aatgcaaa aatgcata aatgccca aatgctta aatggaac aatggatg aatgggtt aatggtta aatggttt aatgtaaa aatgtata aatgtatc aatgtatg aatgtctt aatgtgta aatgttaa aatgttat aatgttta aatgtttc aattaggt aattatgt aattattt aattcttt aatttaaa aattttat acaaaaaa acaaaatg acaaatgg acaattta acacaaaa acacacaa acacacac acacacat acacataa acacatgt acactcac acagtatg acagtttg acataaaa acatacat acatatat acatgggt acatgtta acattaat acattata acattatg actattta actcacac actttttt agaatggt agatgctt agatggtg agatggtt agattagg aggatggg agggatgg aggggatg aggggtct aggggttg agggtatg agggtcat aggtatat aggtcatg agtaaaaa agtaatgt agtataga agtatgtt agttattt agttctta agtttaaa ataaaaaa ataaaatg ataaatat ataacact ataatgca ataatgta ataattag atacaaat atacacac atacacat atacatat atacatta ataccgtt atacttta atagatat ataggggt ataggtat atagtact atagttaa atagttta atagtttg atataaaa atataaat atataatg atatacat atatactt atatagat atatagtt atatataa atatatac atatatag atatatat atatatcc atatatgt atatatta atatattg atatattt atatcatg atatcttt atatgcat atatgcct atatgcta atatggtt atatgtat atatgtca atatgtct atatgtgt atatgtta atatgttt atattaaa atattaat atattaga atattgtt atatttaa atatttat atatttgt atattttt atctattt atgaaatg atgaatgt atgagggg atgcaaaa atgcacat atgcaggc atgcataa atgcatag atgcatat atgcatgc atgccact atgctaaa atgctatg atgcttct atgcttgc atggaaca atggatga atggcaaa atggccaa atggctaa atggctta atggggtc atgggtat atgggtta atggtaaa atggtaga atggtggg atggttaa atggttat atggttta atggtttc atggtttg atgtaaaa atgtaaag atgtaaat atgtaatg atgtaatt atgtacat atgtatat atgtatgt atgtattt atgtcagg atgtcagt atgtcatg atgtcatt atgtctaa atgtctct atgtctta atgtgtat atgtgtcg atgtgtgt atgtgttt atgttaaa atgttaac atgttata atgttatc atgttatg atgttatt atgtttaa atgtttat atgttttc atgttttt attaacta attaatgt attagatg attagggg attagtag attagtat attagttt attatgct attatgtt attatttg attatttt attcatta attgccta attgttta atttaaaa atttaata atttaatt atttacta atttactt atttagtt atttatat atttattt atttcatt atttcctt atttctat atttcttt atttgctt atttgtgt atttgttt attttaaa attttagt attttata attttatg attttatt attttctt attttgtt atttttat atttttgt atttttta attttttt caaaaaat caaaaatg caaaatga caaatggt caaatgtt caataact caatagtt cacacaaa cacacaca cacacacg cacacact cacacata cacacatg cacacgca cacactca cacagaca cacataaa cacataca cacatggc cacatggt cacgcaca cactatag cactcaca cactctct caggcatg cataaatg cataaatt cataatgt catacaca catacata catacatg catataat catatagt catatata catatatt catgcaat catgcata catgcatg catggcaa catgtaat catgtgtt catgttat cattaatt catttttt ccatacat ccatgcac cccaaaag cccaaatg cctaggta cctattta ccttttta cgaaatgg cgcaaatg cgcacatg cgcccaaa cgctatga cggtcatg cgttcttt cgttttta ctaaaatg ctaacaat ctaactat ctaagatg ctaaggta ctaatgta ctaattta ctacatgt ctagggta ctatatat ctatctct ctatgcat ctatttaa ctatttat ctatttta ctcaaatg ctcatgta cttacact cttatatg cttatatt cttatgct cttatgta cttattta cttcttta cttgtaat cttgtact ctttccat ctttcctt ctttctct ctttctta ctttcttt cttttctt ctttttat ctttttct cttttttc cttttttt gaaatggc gaaatggg gaaatggt gaaatgta gaaatgtc gaatggta gaatggtt gaatgtat gacagata gagatggt gatagggg gatatata gatatatg gatatgtc gatgcatg gatggatg gatggggg gatgtaaa gattaggc gcaggggt gcataaat gcatatat gccatgcg gcgcggtg gctttggg gcttttta ggcatata ggcatggg ggcgcggt ggcttttt gggaggcc gggagggc gggagggt gggatggg gggcatga gggctata gggctatg gggcttta ggggatgg ggggcatg ggggggcc gggggggt ggggtagg ggggtagt gggtaggc gggtaggg gggtatga gggtatgt gggtctcg gggttggg ggtaaatg ggtagggt ggtatagg ggtatata ggtatgta ggtcatgg ggtttatg gtaaatga gtaatgta gtacattt gtactaac gtagggat gtagggga gtaggggt gtagttat gtataaac gtataaat gtatacct gtatatat gtatattt gtatgtat gtatgtta gtatgttt gtattatt gtattgtt gtatttat gtatttta gtcttgta gtgagatg gtgaggcc gtgcgttg gttagatt gttaggcc gttatccc gttatgta gttatgtt gttattta gttatttt gttcatgc gttcatta gttcttta gtttaaag gtttatgt gtttattt gtttcatt gtttcgtt gtttctct gtttctgt gtttcttg gtttcttt gtttggct gtttgttt gttttatt gttttctt gtttttat gtttttgt gttttttt taaaaaaa taaaaata taaaacta taaaagta taaaatat taaaatgc taaaatgg taaaatgt taaaggta taaagtat taaatagc taaatata taaatatc taaatgac taaatgcc taaatgtt taaatttt taacagta taacctta taacgtta taactatt taagctta taaggtat taaggtta taagtata taagtatg taataaaa taataatg taatacta taatagtt taatatat taatgaat taatgaca taatgagc taatgata taatgcaa taatgctt taatggtt taatgtaa taatgtat taatgtca taatgtgg taatgtgt taatgtta taatgttt taatttat tacacaca tacacata tacatata tacatgta tacattat tacatttt tacgcttt tactgttt tacttacc tacttgta tactttag tagaaatg tagatata taggaatg taggcatg taggcttt taggggag taggggta tagggtag taggtata taggtatt tagtacta tagtattt tagtggtt tagtgtgc tagtgttt tagttata tagttatt tagttttc tataaaac tataaaat tataaata tataacta tataatgc tataatgt tataatta tataattt tatacata tatactag tatactta tatacttg tatacttt tatagata tatagtat tatagtca tatagtgt tatagtta tatagttg tatagttt tatataaa tatataca tatatata tatatatg tatatatt tatatcta tatatctt tatatgta tatatgtc tatatgtg tatatgtt tatattag tatattat tatattct tatattgt tatattta tatatttg tatatttt tatcttag tatcttat tatctttt tatgatat tatgcaat tatgcata tatgcatt tatgctat tatgcttg tatggtat tatggttt tatgtaac tatgtaat tatgtata tatgtatg tatgtatt tatgtcta tatgtctc tatgtctt tatgttag tatgttat tatgttca tatgttct tatgttta tatgtttc tatgtttt tattaata tattaatg tattaatt tattagta tattatag tattatgt tattattt tattcata tattctat tattcttt tattgtag tattgtat tattgtcc tattgtgt tattgttt tatttaaa tatttaac tatttaat tatttaca tatttact tatttagt tatttata tatttatg tatttatt tatttctt tatttgta tatttgtt tattttaa tattttag tattttat tattttct tattttgt tattttta tatttttc tatttttg tatttttt tcataaat tcatattt tcatgcat tcatgtgt tcattttt tccatgca tccattac tccatttt tccctttt tccgtttt tcctattt tcgctcat tcgttctt tcgttttt tctaatat tctaatgt tctaatta tctagtat tctatttt tctcattt tctccatg tctctaaa tctctaag tctctaat tctctatt tctcttaa tctcttta tctctttt tctgttat tctgttta tctgtttt tcttaatg tcttatgt tcttgttt tctttaaa tctttaac tctttata tctttctt tctttttc tctttttt tgaaatgg tgaatggt tgatatgt tgcataaa tgcgatgg tgcttata tggccaaa tggccatg tggggatg tggtaaaa tggtagag tggtaggg tggttatg tggttctc tggtttag tgtaaaaa tgtaatgt tgtaattc tgtacatt tgtacgta tgtacttt tgtagttt tgtataaa tgtatata tgtatatt tgtatctt tgtatgca tgtatgct tgtatgta tgtatgtt tgtattgt tgtattta tgtatttg tgtatttt tgtcatgt tgtctaaa tgtcttag tgtcttgt tgtctttt tgtgatgg tgtgtatg tgtgtgtt tgtgttta tgtgtttt tgttaagt tgttaatt tgttagat tgttatgt tgttattt tgttcacg tgttcata tgttcatg tgtttaaa tgtttaag tgtttaat tgtttata tgtttatg tgtttatt tgtttctt tgtttgct tgtttgtg tgtttgtt tgttttat tgtttttg tgtttttt ttaaaaaa ttaaaaat ttaaaata ttaaaatg ttaaaatt ttaaatga ttaacaat ttaacact ttaacata ttaactaa ttaactat ttaagtat ttaataaa ttaataat ttaatact ttaataga ttaatatg ttaatatt ttaattaa ttaatttg ttacaata ttacactt ttacccta ttacttgt ttaggcat ttaggcca ttaggtca ttagtact ttagtagt ttagtata ttataaat ttataata ttataatt ttatacat ttatacta ttatactt ttatagtt ttatatat ttatatct ttatatgt ttatatta ttatattg ttatattt ttatccct ttatgata ttatgcta ttatgctt ttatgtaa ttatgtat ttatgtct ttatgtta ttatgttg ttatgttt ttattaaa ttattaat ttattata ttattatg ttattatt ttattctt ttatttaa ttatttac ttatttag ttatttat ttatttcg ttatttct ttatttgt ttattttt ttcaataa ttcataat ttcataga ttcatagt ttcatata ttcatgaa ttcatgca ttcatgct ttccaata ttccatct ttccgttt ttcctatt ttccttat ttcctttt ttcgcttt ttcgttct ttctattg ttctattt ttctcttt ttctgtta ttctgttt ttcttatg ttctttat ttctttct ttcttttg ttcttttt ttgagtgc ttgcaata ttgcgatg ttgggcaa ttgggggt ttggtagg ttgtaata ttgtacta ttgtatgc ttgtatgt ttgtcttt ttgtgtgt ttgtgttt ttgttatt ttgttcat ttgtttat ttgtttct ttgtttgc ttgtttgt ttgttttt tttaaaaa tttaaaac tttaaaat tttaaact tttaaagt tttaaata tttaaatg tttaacaa tttaacat tttaacta tttaataa tttaatat tttaatta tttaattt tttacaat tttacata tttactag tttactat tttacttt tttagttt tttataaa tttataat tttatact tttatata tttatatt tttatgac tttatgct tttatgtt tttattat tttattct tttattgt tttattta tttatttc tttatttg tttatttt tttcaata tttcatat tttcatgt tttcatta tttcattt tttcccta tttcctat tttcctta tttccttt tttcgttc tttcgttt tttctatg tttctatt tttctcta tttctctt tttctgtt tttcttac tttcttat tttcttgt tttcttta tttctttc tttctttg tttctttt tttgctta tttgcttt tttggtta tttggttt tttgtagc tttgtatg tttgtatt tttgttat tttgttta tttgtttc tttgtttg tttgtttt ttttaaaa ttttaaat ttttaata ttttaatg ttttaatt ttttacta ttttactt ttttagta ttttagtt ttttatag ttttatat ttttatgt ttttatta ttttattg ttttattt ttttcata ttttcatt ttttccat ttttcctt ttttcgta ttttctat ttttctct ttttctgt ttttctta ttttcttg ttttcttt ttttgctt ttttgtat ttttgtgt ttttgtta ttttgttc ttttgttg ttttgttt tttttaaa tttttaat tttttaca tttttaga tttttagt tttttata tttttatg tttttatt tttttcat tttttcgt tttttctt tttttgct tttttgtt ttttttaa ttttttag ttttttat ttttttct ttttttgt ttttttta tttttttc tttttttg tttttttt